构建农业转移人口市民化的社会成本分摊机制要通过“内部化”措施，在“成本最小化”的过程中明确分摊主体、落实分摊责任并承担分摊成本。构建社会成本分摊机制需要分阶段、分层次推进制度创新，完善顶层设计。以“内部化”和“最小化”为思路，构建农业转移人口市民化的社会成本分摊机制。要分两个阶段平行推进就业、社会保障、公共服务、土地等制度创新，分两个层次“循序渐进”地完善社会保障、公共服务等制度创新，加快完善顶层设计。