从宗教观念萌芽的旧石器时代中晚期开始，直至汉朝至魏晋南北朝，在历史长河中，生息繁衍在云南大地上的少数民族为适应自然和社会的生活，逐渐形成了与社会发展阶段相适应的宗教信仰，是云南本土民族宗教的发端时期。这一时期大多数民族的宗教信仰带有较强的自发性和原始性。秦汉以来，随着中原王朝对云南统治的进一步加强，一些与汉族通婚、受汉族影响较深的少数民族信仰的“鬼教”已经具备人为宗教的性质。南诏大理政权以降，尤其是元明清时期，儒释道三教对云南边疆少数民族的影响进一步加大，云南民族宗教文化信仰呈现新的面貌。云南民族宗教文化的演进历史，也是地方社会与国家关系、民族关系与宗教关系的缩影，从中可以解读出有益于民族团结、宗教和谐的智慧。