在2009年的大部制改革之前，珠海分别在1983年、1989年、1996年、2001年和2004年进行过五次政府机构改革，每次改革的重点和目的都不一样。其中，1983年的改革主要是为了提高行政效率，推进干部年轻化；1989年的改革重点放在简政放权，理顺政企关系；1996年的改革目的在于转变政府职能，规范行政机制；2001年的改革提出要精兵简政，进一步转变政府职能；2004年的改革目的在于理顺关系，构建服务型政府。而2009年的“大部制”改革重点则放在优化政府组织结构，创新社会管理体制上。
2008年12月，为促进珠江三角洲地区创新优势，进一步发挥其对全国的辐射带动作用和先行示范作用，国家发改委出台了《珠江三角洲地区改革发展规划纲要》，广东再次启动新一轮的行政管理体制改革。2009年，广东省明确提出要推动大部制改革，并选取了四个试点地区：广州市、深圳市、珠海市和佛山市顺德区。2009年11月，珠海市的大部制改革正式开始。